Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam (FMIPA) terbentuk bersamaan dengan berdirinya Universitas Sulawesi Barat. Kementerian Pendidikan Tinggi mengeluarkan izin operasional FMIPA melalui Surat Izin Nomor 229/D/O/2007, dan menaungi satu program studi, yaitu Program Studi Matematika. 

Beberapa tahun kemudian, lahirlah 3 program studi kependidikan di FMIPA yaitu, Program Studi Pendidikan Matematika, Pendidikan Biologi, dan Pendidikan Fisika. Akan tetapi, melalui Peraturan Menteri Riset, Teknologi, dan Pendidikan Tinggi Nomor 42 Tahun 2017 tentang Organisasi dan Tata Kerja Universitas Sulawesi Barat, ketiga program studi tersebut memisahkan diri dengan membentuk Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan (FKIP). 

Kemudian pada tahun 2020, FMIPA membuka Program Studi Statistika. Hingga saat ini FMIPA Universitas Sulawesi Barat mengelola 2 program studi yaitu Program Studi Matematika dan Program Studi Statistika.